Das mit Abstand Interessanteste an der 3DS ist natürlich ihr Display für die dreidimensionale Darstellung. Anfangs hieß es noch, beide Anzeigen der Konsole würden die dritte Dimension beherrschen. Davon ist Nintendo allerdings abgerückt, da Fingerabdrücke auf dem unteren, berührungsempfindlichen Screen den 3D-Effekt zunichte machen.

Das obere, dreidimensionale Display ist mit 3,53 Zoll im Vergleich zu dem der Vorgänger-Version etwas gewachsen. Auch die Auflösung hat Nintendo auf 800 mal 240 Pixel hochgeschraubt. So stehen für jedes Auge 400 mal 240 Bildpunkte zur Verfügung. Der 3D-Effekt funktioniert gut und tatsächlich ohne Brille. Allerdings klappt die Darstellung in der dritten Dimension nur aus einem bestimmten Blickwinkel perfekt.